Personalfil:
    Under sitt första år på Starfleet Academy tränade han som en pilot över Jordens Nord Amerikanska kontinent och han spenderade även några månader på Venus för att lära sig att hantera atmosfäriska stormar, senare lärde han sig även att undvika asteroider i det systemets asteroidbälte. Chakotay var intresserad av arkeologi.
Efter att han tagit sin examen från akademin, så var han en medlem i det Starfleet team som etablerade första kontakten med Tarkannerna.

    Han lämande sen Starfleet och gick med Maquis rörelsen för att försvara sin hemvärld mot Cardassians. Han kommenderade det Maquis skepp som försvann i Badlands 2371, medan de försökte fly från ett Cardassian skepp. Chakotay och hans besättning sveptes iväg till den avlägsna Delta Kvadranten av Caretakern. Deras skepp förstördes sedan av Kazon-Ogla och de var då fångna i Delta Kvadranten. Chakotay och hans besättning gick därför med på att ansluta sig till Voyagers besättning. Chakotay gick också med på att bli Voyagers första officer.

    Chakotay praktiserar sitt folks visions sökande ritualer, sökande vägvisning genom sin djur guide. Han använder sitt medicin knyte under dessa ritualer. Chakotay hedrar sitt folks traditionella medicinala tillämpningar, inklusive användandet av ett medicin hjul för att hjälpa till att guida sin ande tillbaka till kroppen.